· Maka Albarn/Soul Eater: son la pareja protagonista y en torno a ellos gira casi toda la historia. En un principio son dos personas totalmente diferentes: Maka es muy estudiosa (siempre saca dieces en los exámenes), es muy reflexiva e intenta ver todo desde un punto de vista lógico. Mientras que Soul (prácticamente no se usa su nombre completo en la serie) es la fuerza del equipo, es un tipo cool y esto le hace llevarse muy bien con Black Star. Además de esto, sabe tocar el piano, clave en la última parte de la historia.

· Black Star/Tsubaki: al igual que Maka y Soul, esta pareja es muy particular ya que parecen polos opuestos. Black Star es una especie de ninja que tiene una gran velocidad y fuerza, además siempre quiere superar a todo el mundo en todo, incluso al mismo Dios. Tiene un carácter un tanto irritable, lo que le trae más de un problema con Maka, que no lo soporta en algunos momentos. Al contrario que Black Star, Tsubaki es una chica tranquila, con muchisima paciencia y que sabe dar sabios consejos. Puede transformarse en múltiples tipos de espadas ninja.

· Death the Kid/hermanas Thompson: este equipo se incorpora con la serie ya comenzada. Kid (como se le llama durante toda la serie) es el hijo del Shinigami y esta totalmente obsesionado con la simetría. Además de esto es muy fuerte y junto con Patty y Liz (Patricia y Elizabeth Thompson) forman un equipo perfecto... y simétrico, lo cual encanta a Kid. Por ser hijo del Shinigami tiene una fuerza especial y se le encomiendan misiones más complicadas que al resto, sobre todo las relacionadas con las Armas Demoniacas.

· Crona/Ragnarok: hija de una de las malas principales, la bruja Medusa, es uno de los primeros rivales más complicados para Maka y cia debido a la Sangre Negra que posee y que la hace ser casi invencible, ya que esta sangre es dura como el acero. Además, lleva en su interior a Ragnarok, su espada, la cual, con solo gritar es capaz de amplificar las ondas y ser aún más fortífera. Tiene un gran peso a medida que la historia avanza.

· Stein/Spirit: Stein es la abreviatura de Frankenstein, nombre completo del profesor. Como su nombre bien indica es un fanático de la química y los experimentos, sobre todo los relacionados con el cuerpo humano, llegando a experimentar incluso consigo mismo. Es muy fuerte y tiene como arma la mayoria del tiempo a Spirit, una Death Scythe, padre de Maka y que trabaja muy cerca del Shinigami. En otros momentos Stein cambia de arma por Marie, otra Death Scythe.